Jeffrey Cross
Jeffrey Cross

UBiome Citizen Science projekti intervjuu

Me oleme suured fännid, et vabastada teaduslikke uuringuid ainult traditsioonilistes teadusasutustes ja panna see teadlaste kätte, seega oleme uBiome projekti huvitanud. Lühidalt öeldes: "uBiome on kodanikualane teadusprojekt, mis võimaldab avalikkusele juurdepääsu tipptasemel sekveneerimistehnoloogiale, et mõista oma tervist mikrobiomi kaudu." mikrobiomi kohta. Oma saidilt:

Inimese mikrobiom võib olla meie tervisele sama tähtis kui inimese genoom, kuid erinevalt inimese genoomist saab mikrobiomi kergesti muuta. Inimkeha koosneb umbes 100 triljonist mikroobirakust (mikrobiom) ja ainult 10 triljonist inimese rakust. Meditsiiniteadlased on demonstreerinud olulist seost inimeste tervise ja inimkehas elavate mikroobide bioloogilise mitmekesisuse vahel.

Mikrobiomi mikroobid elavad nii nahka kui ka kõrvad, suu, siinused ja sooled. Kui vihmametsade tervis sõltub bioloogilisest mitmekesisusest, toimib inimese mikrobioom kõige paremini optimaalse mitmekesisusega. See mitmekesisus aitab hoida võimalikke patogeene kontrolli all ja reguleerida immuunsüsteemi.

Mikroobid täidavad ka selliseid olulisi funktsioone nagu toidu seedimine ja vitamiinide sünteesimine. Mõned uuringud viitavad ka sellele, et mikroobide aktiivsus mõjutab imetajate meeleolu ja käitumist. Mikroobid sünteesivad kuni 20 protsenti meie vereringes olevatest väikestest molekulidest. Uuringud on seostanud mikrobiomi autismiga, depressiooniga ja ärevusega, samuti paljude soolehäiretega, ekseemiga ja kroonilise sinusiidiga. Imikute tervis näib isegi olevat kasu mikroobide nõuetekohasest külvamisest sünni ajal, kusjuures tervisekahjustused ulatuvad noorukieasse.

Me saime teadlase Jessica Richmaniga rohkem teada.

1. Kes on uBiome'i peamised meeskonnaliikmed? Põhilised liikmed on ise, dr Will Ludington ja dr Zachary Apte. Stanfordis on kraadi majandusteaduses ja teaduses ning tehnoloogia ja ühiskonnas (rõhuasetus infotehnoloogias). Olen praegu Oxfordi ülikooli doktorant ja minu akadeemilised huvid hõlmavad sotsiaalseid võrgustikke, innovatsiooni, kollektiivset luuret ja ettevõtlust. Will on sõltumatu uurija ja Bowes'i kolleeg Berkeley ülikooli molekulaarrakkude bioloogia osakonnas. Ta on spetsialiseerunud soolestiku mikrobiota ökoloogilisele ja evolutsioonilisele dünaamikale ja nende mõjudele peremehe käitumisele, kasutades metagenoomseid lähenemisviise. Zac on biofüüsik, leiutaja ja ettevõtja, kes püüab leida loomingulisi, ainulaadseid lahendusi maailmale silmitsi olevatele probleemidele. Koolitatud nii teoreetiliselt suure energiaga füüsikas kui ka rakubioloogias, ta omab doktorikraadi biofüüsikas UCSF-ist.

2. Mis inspireeris projekti ja kuidas meeskond kokku tulid? uBiome oli inspireeritud minu kaasasutajate kogemustest, kui nad töötasid laboris mikrobiomiga seotud projektidega. Zac ja Will kohtusid UCSFis; Kohtasin Zac'iga Startup Tšiilis, mis on Tšiili valitsuse programm, et luua Tšiili innovatsioonikeskuseks Ladina-Ameerikas.

3. Te olete kõik ülikoolide taustaga, kus te võiksite oma teadustööks rahastada. Miks kodanike teadust? Valisime kodaniku teaduse mõnedel põhjustel. Esiteks võimaldab kodanikuteadus teha rohkem uurimustöid. Teiseks, see võimaldab meil avalikkust otse uurimistegevusse kaasata ja vabastada kodanike teaduse potentsiaal. Meie meeskond on tõesti kirglik kodanike teaduse vastu ja suur osa sellest, miks me seda projekti tegime, oli kaasata avalikkus otse uuenduslikku teaduslikku tööd.

4. omab kogemusi traditsioonilise akadeemilise uurimistööga, mis innustab teid kõige rohkem inimeste teadustöö potentsiaali kohta inimeste poolt? See on suurepärane küsimus. Esiteks on potentsiaal küsida ja vastata küsimustele, mis ei oleks kunagi uurimuses, kuid mis pakuvad suurt huvi paljudele inimestele - meie puhul toitumise, kaalulanguse jms kohta. Samuti on võimalus vabastada teaduslik intelligentsete, läbimõeldud inimeste, kes ei ole „teadlased”, teadlikkus, vaid mõtlevad sügavalt teaduslike küsimuste ja küsimuste üle.

5. Kirjeldage uBiome komplekte ja protsessi, mis toimub, kui proov on teile tagasi saadetud. Komplekt on põhiliselt vatitampoon ja lüüsimislahus. Me saadame selle sulle; siis tampoon oma suu, nina, suguelundid, kõrva taga või soolestiku (jah, sa tõmmake käpapaber tualettpaberist välja). Te täidate ka ulatusliku tervisekontrolli. Sa saadad selle tagasi ja me ekstraktime ja järjestame DNA-d, seejärel saadame teile sisselogimise meie veebisaidile, et näha kolme asja: 1) mis on teie soolestikus või teises kohas, 2) seosed teiste meie prooviga ja 3) korrelatsioonid olemasolevaid uuringuid.

6. Teil on kaasas olev veebileht, kus osalejad saavad oma andmeid visualiseerida ja rohkem teada saada. Kuidas saidi arendati? Praegu arendame veebisaiti oma arvutiteadlaste ja bioinformaatikaga.

7. Mis on teie ja teie meeskonna jaoks kõige olulisem asi, mida olete seni uBiome'iga töötanud? Oleme õppinud palju sellest, mida inimesed meie toodetest mõtlevad, kuidas me peaksime seda arendama jne. Samuti oleme näinud, mida on avalikkuse kirg kodanike teaduses. Väga põnev!

8. Millised konkreetsed pikaajalised eesmärgid on meeskond, kes loodab projekti kaudu saavutada? Loodame tuua mikrobiomi sekveneerimise peavoolu ja õppida väga olulisi asju tervise ja haiguste kohta. Soovime aidata avada sooltehaiguste, vähi ja teiste mikrobiomiga seotud seisundite saladused.

9. Lisaks uBiome projektile, milliseid nõuandeid teil on inimestele, kes on huvitatud kodaniku teadusest? Me ütleksime: “Osalege!” Paljud inimesed on meiega pöördunud oma projektide abistamiseks ja me arvame, et see on fantastiline trend. Lubage mul kasutada võimalust, et ühendada organisatsioon, millega olen seotud ka: Sciencecitizen.org. Me alustasime seda projekti nii, et teised teadlased saaksid õppida, kuidas luua omaenda kodaniku teadusprojekte!

Projekti kohta lisateabe saamiseks ja osalemiseks tutvuge uBiome saidiga, Indigogo lehega ja selle intervjuuga H + ajakirja kohta.

Osa

Jätnud Kommentaari